精细化学中快速强热释放的反应较多，这种温度变化较大的反应不容易控制，而且很容易出现安全事故。硝化反应是较容易出现强热释放的放映，而微通道反应器的应用为这种反应提供了机遇，其有效的解决了这一问题。费托合成反应中也有强热的释放，在微通道反应器中可以有效的控制反应的温度，对反应物的转化率和产物的选择性也提高，反应速率也增大。所以，精细化学反应在微通道反应器中进行可以有效的缓解反应的激烈程度，有效的控制反应，在保证反应正常进行的基础上可以提高反应的安全性。
由于微通道反应器的传质和传热系数较大，所以可以有效的降低反应时间，反应效率也可以提高。甲硅烷基烯醇和4-溴这个反应，在催化剂四丁基氟化铵催化下进行，反应若是想要实现转化率为100%，反应时间需要24h，这个时间比较长，而是用微通道反应器可以有效的降低反应的时间，在微通道反应器中进行这个反应在20min内就能实现100%转化。
精细化学中有很多的反应需要高温高压的环境才能实现反应，而对反应温度和压力的控制也需要比较，但是很多时候传统反应器并不能够有效的控制反应的温度和时间，而微通道反应器可以优化反应，控制好反应的温度和压力。如，Claisen重排反应，这个反应需要使丙烯基苯基醚在250℃高温、1.3MPa高压下1~2h进行反应，这个反应对温度的改变很敏感，若是温度在230℃以下，反应进行就不*，而温度过高就会产生很多的副产物，产物回收率较低。而在微通道反应器中进行此反应，反应在240℃温度和10MPa的压力下，就可以得到纯度较高的产物，副产物只有不到5%。。所以微通道反应器可以有效的提高反应效率，对很多高温高压反应可以更好的进行控制。
